为害根系常见的病害有，根癌病、根腐病、紫纹羽病、白纹羽病。
- 根癌病症状
根癌病又名根瘤病、冠瘿病、根头癌肿病等，主要发生在根颈部，主根、侧根也有发生。瘤形状不定，多为球形。初生瘤乳白色，渐变浅褐至深褐色，表面粗糙不平。鲜瘤横剖面核心部坚硬为木质化，乳白色，老瘤核心变褐色。有的瘤似数瘤连体。
根瘤为害状
发生规律：根癌病是细菌性病害。根癌病菌在肿瘤组织的皮层内越冬，或当肿瘤组织腐烂破裂时，病菌混入土中，土壤中的癌肿病菌亦能存活1年以上。
由于根癌病菌的寄主范围广，土壤带菌是病害主要来源。病菌主要通过雨水和灌溉流水传播；此外，地下害虫如蝼蛄和土壤线虫等也可以传播；而苗木带菌则是病害远距离传播的主要途径。
育苗地重茬发病多，前茬为甘薯的地尤其严重。严重地块病株率达90%以上。土壤湿度大，利于病菌侵染和发病；土温22℃时最适于癌肿的形成，超过30℃的土温，几乎不能形成肿瘤。
碱性土利于发病，酸性土壤病害较少，土质粘重、地势低洼、排水不良的果园发病较重。
防治方法：
（一）严格检疫和苗木消毒，可能带病的苗木和接穗，应进行消毒，可用1%的硫酸铜液浸5分钟或2%石灰液浸1~2分钟，苗木消毒后再定植。定植前根系浸蘸K84菌剂，对根瘤病的防治效果较好。
（二）加强果园管理：
适于根癌发生的中性或微碱性土壤，应增施有机肥，提高土壤酸度，改善土壤结构；注意防治地下害虫和土壤线虫，减少虫伤；平时注意雨后排水，降低土壤湿度。加强肥水管理增强树势，提高抗病力。
（三）刮除病瘤或清除病株：
发现园中有个别病株时应扒开根周围土壤，用锋利小刀将肿瘤彻底切除，直至露出无病的木质部。刮除的病残组织应集中烧毁并涂以高浓度石硫合剂或波尔多液保护伤口，以免再受感染。
- 根腐病症状
病树外观生长不良，叶色黄、早落，最后植株枯死。夏天，病株忽然萎蔫。其症状通常在1~2个大枝出现，1~2 年后扩展到全树。树根和根茎枯死。在枯死的褐色树皮和木质部之间，呈现白色或浅黄色、扁平、扇状、羽绒状的菌块，逐渐呈黑褐色，稍带光泽。腐朽的树皮不酸，也不腐烂，但发出很浓的腥味，这是鉴定本病的特征之一。病菌也传入下面的木质部，引起均匀的白腐。
防治方法：
- 加强果园管理：
地下水位高的果园，应做好开沟排水工作，雨后及时排除积水。注意改良土壤，增施肥料，合理整形修剪，调节果树负载量，加强对其他病虫害的防治，促使根系生长旺盛，增强树体抗病力。
（二）对整条腐烂根，要从根基部锯除，同时，仔细刮除根颈病斑病皮层，并且向下逐寻，直至将病根挖净。如大部分根系发病，要彻底清除所有病根，在清除病根过程中，需细心保护健根，不要轻易损伤之。对伤口须用杀菌剂涂抹或喷布消毒，再涂以波尔多浆等保护剂。
常用消毒剂有1%~2%硫酸铜溶液，250~300倍的五氯酚纳液或50%退菌特可湿性粉剂200倍液，50%多菌灵200倍液等。最后用无病土或药土覆盖。药土的配制，可用70%五氯硝基苯以1:500~100的比例与换入新土混合即成。将药土均匀地施于根部，8~10年生大树，每株0.25千克左右即可。
三、白纹羽病
症状：感病植株可能很快枯死，也可能年内慢慢枯死，或几年才枯死。迅速枯死的树，叶片仍附着树上；逐渐枯死的树叶片细小，通常呈枯萎状，但新梢尚能从基部抽出。由于根系严重恶化，易把病株从土内拔出。通常病株在地平线处折断，这是因病菌的寄生，致木质部弱化的缘故。
地平线以下的树皮变黑，也容易脱落，在根头出现黑色的胶状溢出物。在潮湿情况下被感染的根表面，病菌形成许多菌丝，呈白色羽绒状。菌丝多沿小根生长，通常在根周围的土粒空间形成扁的菌丝束，后期菌丝束色变暗，外观为茶褐色或褐色。
防治方法：
选栽无病苗木：起苗和调运时，应严格检验，剔出病苗，建园时选栽无病壮苗。如认为苗木染病时，可用10%的硫酸铜溶液，或20%石灰水，70%甲基托布津500倍液浸渍1小时后再栽植。
四、紫纹羽病：治疗方法同上。
